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在CyberArticle裡面，依次點擊「主選單 -> 工具 -> 選項」，可以對CyberArticle進行全面的設定：
語言：設定CyberArticle介面所使用的語言。需要重新執行CyberArticle。
風格：設定CyberArticle介面所使用的風格。需要重新執行CyberArticle。
實例：可以設定是否只允許執行一個CyberArticle程式。
位址列：可以設定是否在CyberArticle介面上面顯示一個位址列。
瀏覽器按鈕：是否現實瀏覽器按鈕：後退，前進，首頁，我的最愛。
Tabs：設定TAB的顯示位置。
CyberArticle訊息：是否接收顯示CyberArticle訊息，是否顯示註冊資訊。

顯示文章：可以設定是否在CyberArticle資料夾視窗中，顯示文章節點。需要重新執行CyberArticle。
同一時間，只能開啟一本書即：設定是否允許資料夾視窗同時開啟多本書籍。
動作：選擇滑鼠按兩下/按一下時候的操作。

一般：顯示常用資料夾：設定是否顯示常用資料夾。
當CyberArticle啟動時，開啟「最近的文章」：設定在CyberArticle啟動時，是否直接顯示 最近儲存的文章。
最近的文章：設定最近的文章顯示的數量。
未讀的文章：設定未讀的文章顯示的數量。
搜尋結果：設定允許顯示的最大的搜尋結果數量。
顯示的項目：設定在常用資料夾視窗裡面，顯示的常用資料夾的項目。

樣式：
設定節點列表的樣式。可以選擇經典樣式或者Outlook 2003樣式。經典樣式，類似於Outlook Express信件顯示方式，而Outlook 2003樣式，則類似Outlook 2003的信件顯示方式。
其中經典樣式，適合將節點列表視窗放在主視窗的右上角顯示，而Outlook 2003樣式，則適合於將節點列表，同資料夾視窗並列顯示（適合寬螢幕使用者）。
您可以設定自動切換樣式，當節點列表視窗的寬度小於設定的寬度時，將採用Outlook 2003樣式，否則採用經典樣式。
經典樣式：您可以設定經典樣式所顯示的內容：。

閱讀文章：您可以設定後自動將文章標記為已讀，以及標記為已讀的時間。
Tab：您可以設定是否自動在新視窗中開啟文章。
啟動：您可以設定，是否開啟您最後一次關閉程式時，瀏覽的文章。
自動開啟檔案：設定是否自動開啟附件檔案，例如pdf檔案。